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En direct du labo, Les trois conformations de l’ADN, 27/06/2018, En Direct du Labo on Twitter / X

Depuis 1950, des recherches ont démontré l'existence de différentes conformations de l’ADN ayant des structures particulières : la forme B est en double hélice régulière, la A est plus compacte et la Z présente une hélice gauche différente et est plus riche en cytosine et guanine. Intriguées, nous nous demandons quels facteurs environnementaux déterminent l’adoption de différentes conformations de l’ADN (A,B et Z) et comment peuvent-elles être exploitées en génie génétique.Pour cela nous avons réalisé une extraction d’ADN de banane. Les méduses ont été disposées dans deux milieux : aqueux et éthanol et colorées au bleu de toluidine. Nous avons ensuite effectué une électrophorèse. Nous pensons que la baisse d’hydratation favorise une modification de sa conformation qui sera plus compacte, augmentant ainsi sa vitesse de migration. Nous avons préparé un gel d’agarose. Puis placé le gel dans la cuve d’électrophorèse, rempli les puits avec des solutions d’ADN à l’aide d’une propipette, lancé le courant, et enfin coloré le gel au bleu de méthylène pour visualiser la migration, sans résultat observable. Notre expérience analytique in vitro n’a pas fonctionné notamment car nos méduses d'ADN étaient trop compactées pour pouvoir migrer dans le gel. Notre hypothèse ne peut être validée par celle-ci, néanmoins les travaux de Rosalind Franklin, entre autres, ainsi que nos observations sur nos méduses d’ADN qui remises en milieu aqueux se dissolvaient, permettent de la valider. La forme A est plus compacte que la forme B, qui est plus visqueuse, cette différence aurait pu être démontrée par un test de viscosité. Des facteurs physico-chimiques comme le pH, la salinité et environnementaux comme le stress hydrique que nous avons étudié peuvent modifier la structure de l'ADN, ce qui pourrait être utile dans le génie génétique. On pourrait créer localement de l’ADN Z pour réduire l’activité d’un gène problématique.